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GEO数据结构GEOquery 数据结构大致分为两类。第一种是GDS, GPL和GSM,他们的操作和数据类型差不多；第二种是GSE，GSE数据是由GSM和GPL整合而成。GPL，GEOPlatform (GPL) 芯片平台GSM，GEO Sample (GSM) 样本ID号GSE，GEO Series (GSE) study的ID号GDS，GEO Dataset (GDS) 数据集的ID号一...

SMRsummary data-based Mendelian randomization (SMR)，参考文献回顾MR的原理如果一个基因变异Z 是某个暴露因素X的因果变量，并且对结果Y没有直接因果关系，那么这个基因变异Z与结果Y的关联，只能通过X对Y的因果关系而被观察到（X->Y）。两阶段最小二乘法通常我们可以用两阶段最小二乘法（2SLS，2 stage least squared ...

MungesumstatsBioconductor - MungeSumstatsneurogenomics/MungeSumstats: Rapid standardisation and quality control of GWAS or QTL summary statistics (github.com)安装if (!require("BiocManager",...

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