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microRNAmiRNA及相关的数据库(1)microRNA (miRNA)是一组由基因组编码的长度约20~23个核苷酸的非编码RNA,通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体(RISC)降解mRNA或阻碍其翻译。miRNA在物种进化中相当保守,在植物、动物和真菌中发现的miRN大部分在特定的组织和发育阶段表达。(2)miRBase数据库(http://www.mirbase.org/)...
GEO数据结构GEOquery 数据结构大致分为两类。第一种是GDS, GPL和GSM,他们的操作和数据类型差不多;第二种是GSE,GSE数据是由GSM和GPL整合而成。GPL,GEOPlatform (GPL) 芯片平台GSM,GEO Sample (GSM) 样本ID号GSE,GEO Series (GSE) study的ID号GDS,GEO Dataset (GDS) 数据集的ID号一...
SMRsummary data-based Mendelian randomization (SMR),参考文献回顾MR的原理如果一个基因变异Z 是某个暴露因素X的因果变量,并且对结果Y没有直接因果关系,那么这个基因变异Z与结果Y的关联,只能通过X对Y的因果关系而被观察到(X->Y)。两阶段最小二乘法通常我们可以用两阶段最小二乘法(2SLS,2 stage least squared ...
MungesumstatsBioconductor - MungeSumstatsneurogenomics/MungeSumstats: Rapid standardisation and quality control of GWAS or QTL summary statistics (github.com)安装if (!require("BiocManager",...
Gitlab安装文档:https://docs.gitlab.cn/jh/install/docker.htmlgitlab runner:https://cloud.tencent.com/developer/article/1803787gitlab runner 的 Vue部署:http://www.javashuo.com/article/p-bcjuzymi-cn.htmlDock...