Loading... # A metabolomics pipeline for the mechanistic interrogation of the gut microbiome - 分层次对单个细菌进行聚类 - 在某些情况下,两个密切相关的物种显示了不同的代谢组学图谱与代谢水平的相似性(et5a,b)。 - 在其他情况下,系统发育相似性伴随着代谢模式的相似性(et5a,b)。 > 通过代谢组学特征距离对物种进行分层聚类,发现在系统发育上较远的物种之间出乎意料地共享代谢模式 > > (et6a-c)。 > - 菌株代谢与系统发育之间的关系 - 利用菌株分解的代谢组学和基因组学数据,在单一多胺生物合成途径(fig2b 和et7k)的背景下,研究细菌遗传和代谢变异之间的相关性 - 目前基于系统发育或基因组预测细菌菌株代谢功能的能力有限,并强调了测量代谢表型以识别产生可能影响宿主生物学的特定代谢物的菌株和基因的实用性 > 代谢表型长期以来作为微生物分类的标准,在本文中,作为随机森林模型的子节点, > 最后修改:2022 年 01 月 18 日 © 允许规范转载 赞 如果觉得我的文章对你有用,请随意赞赏